当協会は、全国の食品衛生協会と連携を図り、飲食等に起因する感染症、食中毒その他の危害の発生を防止するための諸事業を行うとともに、食品関係事業者への食品の品質及び食品衛生管理の指導等並びに消費者への食品衛生知識の向上のための普及啓発を行い、もって公衆衛生の向上と県民の健康増進に寄与することを目的とする。

上記目的を達成するために、次の事業を行う。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　1.食品衛生指導員の専門的知識・技能の普及及び人材育成事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　2.食品営業施設巡回活動事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　3.食品衛生の向上に関する各種講習会事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　4.秋田県HACCP認証事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　5.食品衛生思想の普及活動事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　6.共済事務補助事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　7.食品等自主検査、水質検査及び腸内細菌検査実施推進事業　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　8.会員の表彰、交流に関する事業